Основными задачами транспортной службы УИС является планирование, организация, контроль, учет, анализ и прогнозирование работы подведомственного автомобильного транспорта, профилактика и предупреждение дорожно-транспортных происшествий в учреждениях УИС, а также развитие материально-технической базы.
В настоящее время на службе в уголовно-исполнительной системе края для решения оперативно-служебных задач используются специальные автомобили, предназначенные для конвоирования осужденных и лиц, находящихся под стражей, легковые автомобили и автобусы для перевозки личного состава, грузовой автотранспорт, специальные боевые и производственные машины. Современный автопарк красноярского ГУФСИН насчитывает более 2000 единиц техники.
Гордостью ГУФСИН является медицинский автопоезд. Мобильная поликлиника оборудована на базе автомобилей высокой проходимости: четырех автомобилей марки «КАМАЗ», двух «УРАЛов», двух легковых автомобилей для перевозки оборудования и персонала. Это позволяет автопоезду заезжать в отдаленные, труднодоступные населенные пункты Красноярского края, где зачастую отсутствует узконаправленная медицинская помощь. В автомобилях установлена автономная система обогрева, с помощью которой медицинский персонал может работать при низких отрицательных температурах.
В штатах транспортной службы учреждений ГУФСИН работают и несут службу более 350 человек – это аттестованные и вольнонаемные водители, диспетчера, автомеханики и автослесари, которые обеспечивают бесперебойную работу всего краевого пенитенциарного ведомства.
Напомним, первые два специальных автомобиля для перевозки арестантов (отечественного производства завода «Г.А.Лесснеръ» и производства Ново-Берлинской фабрики «Г.Ф.Маркъ и Ко») находились в эксплуатации в распоряжении Санкт-Петербургской конвойной команды при Временной тюрьме и, начиная с 28 июля (11 августа по новому стилю) 1908 года, начали эксплуатироваться для специальных перевозок заключенных внутри города.
В 2017 году приказом ФСИН России 11 августа объявлен Днем транспортной службы уголовно-исполнительной системы.